1947年由陳宗器、顧功敘、王之卓、翁文波四位科學(xué)家發(fā)起，1947年8月3日在上海成立，中國地磁學(xué)家陳宗器為首任理事長。1948年10月在南京召開首屆年會，會議就地球物理學(xué)的研究目的和范圍進(jìn)行了討論，以測地學(xué)、地震學(xué)、氣象學(xué)、地磁及地電學(xué)、火山學(xué)、海洋學(xué)、水文學(xué)、地殼構(gòu)造物理學(xué)、應(yīng)用地球物理學(xué)9個學(xué)科為主。設(shè)立地球物理名詞審定委員會，并確定組織學(xué)術(shù)交流和出版作為學(xué)會的主要活動。1954年2月遷址北京，1957年2月召開第一屆會員代表大會。推舉趙九章為中國地球物理學(xué)會理事長。歷任理事長依次為：陳宗器、趙九章、顧功敘、翁文波、劉光鼎、王水、陳颙和陳曉非。

中國地球物理學(xué)會作為民間社團(tuán)，除為會員、地球物理工作者營造一個滿意的會員之家外，特別注重為國家發(fā)展和經(jīng)濟(jì)建設(shè)獻(xiàn)計獻(xiàn)策?！爸袊蜌赓Y源二次創(chuàng)業(yè)” “建立國際地磁子午鏈” “油儲地球物理立項” “中國加入國際海洋法組織”等建議，均受到國家和有關(guān)部門的重視。學(xué)會成立以來圍繞國家經(jīng)濟(jì)建設(shè)開展了一系列活動，并建立了固體地球物理、勘探地球物理、地球物理技術(shù)、地磁與高空物理、天災(zāi)預(yù)測、環(huán)境地球物理、中國大陸動力學(xué)、海洋地球物理、工程地球物理、信息技術(shù)、流體地球科學(xué)、地球電磁、國家安全地球物理、空間天氣、礦山地球物理、地?zé)帷\地表、巖石物理、行星物理和油氣地球物理20個專業(yè)委員會，組織、國際交流、學(xué)術(shù)交流、宣傳出版、社會服務(wù)、科普、繼續(xù)教育、科技推廣中心和學(xué)生工作9個工作委員會。截至2017年9月，單位會員73家，個人會員16 273人，其中國科學(xué)院和中國工程院院士56人。學(xué)會的學(xué)術(shù)刊物為《地球物理學(xué)報》（月刊）、《地球物理學(xué)進(jìn)展》（雙月刊）、《Applied Geophysics》（季刊）和《Earth and Planet Physics》。

每年一屆的學(xué)術(shù)年會吸引了越來越多的科技人員參加，規(guī)模已經(jīng)達(dá)到近2400人；每年召開的國際學(xué)術(shù)交流會也吸引了越來越多的國家地球物理專家參加。每年頒發(fā)中國地球物理科技獎、顧功敘地球物理科技發(fā)展獎、傅承義青年科技獎和陳宗器優(yōu)秀論文獎。

作為學(xué)會改革的先鋒，在中國科協(xié)的支持下，1987年12月學(xué)會改革了單一掛靠體制，實行“多支持體制”。主要支持單位有：中國科學(xué)院、國土資源部、中國地震局、中國石油天然氣總公司、中國石油化工集團(tuán)公司、中國海洋石油總公司、中國煤炭地質(zhì)總局和中國冶金地質(zhì)總局等。理事會、常務(wù)理事會、專業(yè)委員會成員實行民主選舉，學(xué)會干部實行聘任制。中國地球物理學(xué)會通過學(xué)科間的交叉、滲透和綜合，努力推動地球物理學(xué)科的發(fā)展和創(chuàng)新，為經(jīng)濟(jì)建設(shè)服務(wù)。